עמית בכיר במכון ון ליר בירושלים מאז 2006 וממייסדי התוכנית לכלכלה וחברה במכון. מכהן כפרופסור לכלכלה בקתדרה ע"ש פול איוניר לכלכלה ניהולית באוניברסיטת בן-גוריון בנגב. בשנים 2002–2006 היה משנה לנגיד בנק ישראל, ושימש ראש המחלקה לכלכלה ודיקן הפקולטה למדעי הרוח והחברה באוניברסיטת בן-גוריון בנגב. שימש כמרצה אורח במחלקות לכלכלה בארצות הברית – וביניהן אוניברסיטת בראון, אוניברסיטת בוסטון, אוניברסיטת פנסילבניה ואוניברסיטת קליפורניה – ולימד בהן לתואר ראשון ולתארים מתקדמים. במהלך המחאה החברתית של 2011 עמד יחד עם פרופ' יוסי יונה בראשות צוותי המומחים של המחאה. מסקנות הצוותים התפרסמו בספר "אפשר גם אחרת – מתווה לכינונה של חברה מתוקנת" בעריכתם של ספיבק ויונה